Theo Viện Quy hoạch đô thị và nông thôn quốc gia- Bộ Xây dựng, định hướng phát triển không gian tổng thể thành phố Phú Quốc đến năm 2040, Phú Quốc sẽ có 12 phân vùng phát triển dựa theo các đặc điểm cảnh quan, sinh thái tự nhiên, đặc điểm địa hình và các điều kiện hiện trạng khác. Các phân vùng sẽ tận dụng các tiềm năng và cơ hội của mỗi khu vực đặc trưng trong khu vực lập quy hoạch, tạo điều kiện để Phú Quốc phát triển năng động, hiệu quả và có bản sắc về kinh tế- xã hội- cảnh quan với chất lượng tương xứng với đô thị loại 1 và thành phố du lịch quốc tế.
Theo đó, Phú Quốc sẽ phát triển các khu đô thị du lịch và các khu chức năng tại các khu vực ven biển, ven sông, dọc các hành lang sinh thái tự nhiên. Tuy nhiên, trong các khu vực này sẽ được tổ chức giao thông chậm, ưu tiên đi bộ, đi xe đạp, quy mô đường giao thông vừa đủ, không quá lớn để không làm suy giảm chất lượng đô thị du lịch, tạo các cấu trúc đô thị gắn bó với đặc trưng về sinh thái, cảnh quan và địa hình tại từng khu vực.
Bên cạnh đó, quy hoạch chung cũng cần bổ sung quỹ đất phát triển mới với quy mô phù hợp, lân cận các khu dân cư hiện hữu, bổ sung chức năng và hoàn thiện không gian cho các khu vực dân cư hiện hữu, đặc biệt là các không gian công cộng, tín ngưỡng, lưu trữ và chế biến...
Phát biểu tại buổi làm việc, Chủ tịch UBND tỉnh Lâm Minh Thành yêu cầu đơn vị tư vấn là Viện Quy hoạch đô thị và nông thôn quốc gia và Tập đoàn Wimberly Allison Tong & Goo tiếp thu ý kiến đóng góp tại cuộc họp để hoàn thiện Đồ án quy hoạch chung. Trong đó, bám sát các căn cứ pháp lý hiện hành để thực hiện quy hoạch, thường xuyên cập nhật quy định pháp luật để bổ sung, hoàn thiện Đồ án quy hoạch.
Về nội dung quy hoạch, Chủ tịch UBND tỉnh Lâm Minh Thành lưu ý đơn vị tư vấn đặc biệt quan tâm đến vấn đề giao thông, hệ thống hạ tầng thoát nước đô thị cho Phú Quốc, đồng thời trong quy hoạch, cần lưu ý bảo vệ rừng quốc gia và quỹ đất nông nghiệp của thành phố. Bên cạnh đó, định hướng phát triển Phú Quốc thành đô thị loại 1, cần nghiên cứu mở rộng quy mô đô thị Dương Đông và An Thới; nghiên cứu lại việc lấn biển và quỹ đất của bờ đông đảo Phú Quốc. Ngoài ra, quy hoạch chung cần bổ sung thêm phương án dự phòng, tạo sự phong phú cho tỉnh khi tổ chức hội thảo để có sự so sánh, bàn bạc và đi đến thống nhất cao.